1、首先，打开FlowJo，进入工作台，你需要找到你的原始数据，通常以fcs格式存储。点击Ctrl+A全选所有文件，然后直接拖拽到All Samples区域，如图像所示。在数据预处理阶段： 创建散点图 - 点击fcs文件，你会看到默认的SSC（侧向散射）在X轴，FSC（前向散射）在Y轴。这两个参数揭示了细胞的大小和复杂度。
2、分析过程中，双击 Lymphocytes 选中细胞群，根据实验目的和染料特性，选择合适的横纵坐标进行分析。点击横坐标边上的 T，可将横坐标数值转换为对数值，便于观察。完成分析后，关闭处理界面返回主界面。
3、首先，启动FlowJo软件后，通过“Add Samples...”功能导入数据，也可直接拖拽单个数据或文件夹至软件界面，操作快捷方便。接下来，进行横纵坐标调节。双击数据打开FSC-SSC图，通过“T”按钮进行自定义轴设置，修改“Scale”中的数值调整坐标大小，以此得到直观的数据视图。
4、首先打开FlowJo1软件，鼠标直接拖动数据所在文件夹到软件中，数据导入。然后对数据进行处理，双击fcs格式数据出现流式散点图，圈门并点击确定。然后双击圈门部位，根据实验目的以及染料的荧光激发或者发射波长，选择流式图合适的横坐标和纵坐标。
5、打开flowjo软件，导入原始数据并且进行初步的门分析。将分析的框架批量覆盖所有样本，批量圈门。打开Tableeditor（数据统计）模块，将任意样本的门逻辑拖入Tableeditor框架中。在通道中标注一下圈门的命名。有需要可添加heatmap效果（该效果仅体现在html中，excel无法导出此热图效果）。
6、flowjo.导出以后用ai编辑的步骤如下：散点图中怎样调整坐标轴的范围（备注：只有FCS0格式的数据可以在散点图中调整坐标轴的范围。
